Project uitgelicht: COVID-19 onderzoek met Artificial Intelligence in Medical Delta Fieldlab Phenomix

donderdag 16 juli 2020

Naam: COVID-19 samenwerking Medical Delta Fieldlab Phenomix
Doel: Verklaring vinden voor verschillen in ziekteverloop COVID-19; maken van patiënttypes
Beoogd resultaat: Behandelingsstrategie scherper kunnen bepalen
Partners: LACDR/Universiteit Leiden; Euretos; Mimetas, LUMC, Erasmus MC, UMC Utrecht
Status: Doorlopend onderzoek; eerste resultaten verwacht in Q3 2020


Hoe kan het dat sommige corona-patiënten ernstig ziek worden en anderen niet? Dat zich bij sommige patiënten infecties opdoen? Dat behandelingen wisselend aanslaan? Of dat een zogeheten cytokine storm afgeremd moet worden bij de ene patiënt, terwijl het immuunsysteem bij een op het oog soortgelijke patiënt juist een boost moet krijgen?

Het zijn dit soort vragen dat een samenwerking van bedrijven, artsen en wetenschappers probeert te ontrafelen aan de hand van onder andere metabole data. Deze interdisciplinaire samenwerking is exemplarisch voor de projecten die vanuit het Medical Delta Fieldlab Phenomix op het Leiden Bio Science Park opgepakt worden. In dit fieldlab, dat deze maand zijn deuren opende, werken bedrijven, zorginstellingen en wetenschappers samen aan projecten die een directe impact hebben op onder andere biotech, de farmaceutische industrie en daarmee de zorg in het geheel.

Euretos is een van de bedrijven die aan deze COVID-19 samenwerking meewerkt. Het Utrechtse technologiebedrijf is gespecialiseerd in data-gedreven analyses om de moleculaire processen achter ziektebiologie beter te begrijpen. Binnen het fieldlab is een metabool profiel gemaakt van patiënten en is in organ-on-a-chip modellen op basis van de Mimetas OrganoPlates gekeken naar de moleculaire impact van het virus op corona-symptomen, zoals vaatlekkage en trombose. Vanuit het Euretos platform kijken onderzoekers naar mogelijke verklarende mechanismen die het metabole profiel koppelen aan de waargenomen symptomen. Stapsgewijs ontstaat zo een steeds scherper beeld van bepaalde patiëntprofielen.

“In deze cyclus van data verkrijgen, analyseren, rationaliseren en vervolgens opvallende zaken verder uit diepen met verdere experimenten en metingen, bewijst het fieldlab duidelijk zijn meerwaarde,” zegt Arie Baak, medeoprichter van Euretos. De samenwerking in het fieldlab versnelt en verbetert dat proces; artsen, technici en wetenschappers werken doorlopend aan het onderzoek. Bovendien loopt het fieldlab voorop in het gebruik van nieuwe technologieën en automatisering. Dat levert niet alleen nieuwe inzichten op, het versnelt ook het proces van ‘sample tot analyse’.

Het samenwerkingsverband hoopt op basis van de biologische patiëntprofielen, bestaande uit zowel genetische als metabole kenmerken, het ziekteverloop van coronapatiënten beter te kunnen begrijpen. Dit kan helpen een betere behandeling te vinden van coronapatiënten. Het doel is dat een arts op basis van een bloedafname kan inschatten of bepaalde medicatie of een specifieke behandeling op een bepaald moment aanslaat of juist schade toebrengt bij een patiënt. Medicatie kan een op hol geslagen immuunsysteem afremmen, maar wat je niet wilt is dat daardoor het virus vrij spel heeft. “Uiteindelijk moet ons project artsen helpen in het maken van dit soort behandelkeuzen.”

Afbeelding: een voorbeeld van één van de rationalisatiemethodes die toegepast wordt waarbij de verbanden uit databases en literatuur gevisualiseerd worden in een relation map. Hierdoor worden directe en indirecte verbanden uit zowel literatuur als eerdere experimentele data direct zichtbaar.

Cookie melding

Deze website maakt gebruik van cookies. Cookies zijn tekstbestanden die op de computer worden geplaatst wanneer websites worden bezocht. Ze worden veel gebruikt om websites efficiënt te laten werken en om informatie te verstrekken aan de eigenaren van de website. Hieronder kan aangegeven worden of u de cookies accepteert.